EDI电子商务系统的实施与任何其他技术系统实施的不同就在于其系统的复杂性和所涉及的部门和机构的广泛性。EDI系统的实施要改变企业运作的整个流程。因此，对于企业来讲，与其说EDI的实施过程是一种技术手段的更新和实施过程，还不如说是对企业内部以及与其有关的贸易伙伴的教育与培训过程。这也是信息时代的企业管理与传统企业管理最大的不同所在。知识管理已经在企业管理中占据了非常重要的地位。从发达国家的企业所走过的历程看，EDI的实施能否成功很大程度上要靠企业观念的转变和知识管理的程度。
EDI电子商务系统在不同行业的实施应用。
在EDI应用推广近二十年来，使用EDI较多的产业可划分为以下四类：
（1） 制造业
JIT（Just In Time即时响应）以减少库存量及生产线待料时间，降低生产成本。
（2） 贸易运输业
快速通关报检、经济使用运输资源，降低贸易运输空间、成本与时间的浪费。
（3） 流通业
快速响应，减少商场库存量与空架率，以加速商品资金周转，降低成本。建立物资配送体系，以完成产、存、运、销一体化的供应线管理。
（4） 金融业
EFT电子转账支付，减少金融单位与其用户间交通往返的时间与现金流动风险，并缩短资金流动所需的处理时间，提高用户资金调度的弹性，在跨行服务方面，更可使用户享受到不同金融单位所提供的服务，以提高金融业的服务品质。